JACS | 正交修饰蛋白质N-半胱氨酸

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给大家分享一篇发表在JACS上的文章,题为:Platform for Orthogonal N‑Cysteine-Specific Protein Modification Enabled by Cyclopropenone Reagents。本文的通讯作者是来自西班牙Basque Research and Technology Alliance (BRTA)的Gonzalo Jiménez-Osés和来自剑桥的Goncalo J. L. Bernardes。

    蛋白质偶联物,如抗体药物偶联物(ADC)和聚乙二醇化蛋白质等,都具有重要的医用价值。在用于蛋白质偶联的各种策略中,天然氨基酸的修饰仍然是首选方法,因为它直接、便捷,无需通过遗传学手段改变蛋白质序列。理想情况下,偶联反应需要具有位点选择性,且化学反应完全,以生成结构明确的蛋白质偶联物,这是ADC等多种医药领域应用的关键要求。同样,这种转变应在室温和生理 pH 值的水溶液环境中迅速发生。尽管近年来已经开发了许多蛋白质偶联策略,但当蛋白质中存在其他具有相似反应性侧链时,修饰蛋白质上的一个特定氨基酸仍然是一个挑战。

    赖氨酸和半胱氨酸是生物偶联中修饰最多的氨基酸,因为它们在生理条件下是亲核的。天然赖氨酸残基是非常便于修饰的位点,但它们在蛋白质表面很丰富,因此很难对给定的残基实现高度选择性。相反,半胱氨酸残基在蛋白质中的丰度较低 (<2%),位点选择性更好。然而,当依赖半胱氨酸残基进行蛋白质修饰时,必须考虑以下几个因素。首先,半胱氨酸残基通常会形成对蛋白质结构至关重要的二硫键,对这些残基进行修饰会导致蛋白质功能丧失。此外,许多表面暴露的内源性半胱氨酸残基直接关系到蛋白质的催化活性,因此不能用于修饰。所以,如何在一种蛋白质中区分不同半胱氨酸残基的方法具有重要的意义。因此,研究人员已经开发了许多N端半胱氨酸的修饰方法(图1)。

    本文作者利用环丙烯酮(CPO)官能团,设计了一种单取代的CPO试剂,用于蛋白质或多肽N末端半胱氨酸的特异性修饰。在这个设计中,单取代的CPO能够在温和的、生物友好的环境下,与N 端半胱氨酸残基的 1,2-氨基硫醇基团反应,生成稳定的1,4-thiazepan-5-one(图1)。即使蛋白质中还存在其他暴露在溶剂中的半胱氨酸残基,也仍然可以选择性地只修饰N端的半胱氨酸。

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图1. N端半胱氨酸特异性修饰的方法


    为了证实这一点,作者用TCEP将一个用二硫键连接的环肽血管加压素(P5)断开,使得短肽上暴露出两个半胱氨酸的巯基,当P5与2-氰基苯并噻唑(CBT)反应时,可以同时得到单位点修饰和双位点修饰的产物,而CPO却选择性的只与N末端的半胱氨酸反应(图2)。

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图2. CPO特异性修饰多肽N端的半胱氨酸


    同样,这种方法不仅适用于简单的多肽,还适用于复杂的蛋白质体系。作者将同时包含N端半胱氨酸和蛋白内半胱氨酸的双突变GFP(2×cys-GFP)与CPO-PEG反应,在二硫苏糖醇(DTT)环境下能够顺利形成GFP的PEG偶联物。并在除去多余的CPO和DTT后,蛋白质内半胱氨酸还能与苯甲酰丙烯酸反应(图3)。而在缺少DTT的环境下,则会迅速(<5 min)形成蛋白质二聚体。

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图3. CPO-PEG 和苯甲酰丙烯酸试剂选择性修饰 2×cys-GFP


    除此以外,基于 CPO 的试剂能够在两种蛋白质之间进行无铜点击反应。从头设计的 cys-nIL2 就是一个很有趣的应用场景。因为与单体 nIL2 相比,二聚化会增强与 IL2-β受体的结合。因此,作者用CPO-N3和CPO-DBCO 分别处理 cys-nIL2,然后将两种正交标记的蛋白质混合,二聚体 (nIL2)2 在30分钟内就能够形成(图4)。

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图4. 使用基于 CPO 的化学方法制备 cys-nIL2 的共价二聚体


    综上所述,作者开发了一种有效的方法来选择性地修饰肽和蛋白质上的 N 末端半胱氨酸残基。利用CPO试剂进行正交修饰,与常见的还原剂二硫苏糖醇 (DTT) 兼容,更便于处理易于二聚化的蛋白质。并且区分和特异性靶向蛋白质上的 N 末端半胱氨酸残基的能力有助于构建精细的多标记生物偶联物。


作者: HYH    审校: LXY

DOI: 10.1021/jacs.2c02185

Link: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.2c02185


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