推荐一篇发表在Nature chemical biology上的文章，通讯作者是德国马克思普朗克生物化学研究所的Brenda A. Schulman教授和滑铁卢大学的Sachdev S. Sidhu教授。Brenda A. Schulman教授的研究方向是泛素和泛素样蛋白翻译后修饰的调控机制，Sachdev S. Sidhu的研究方向是通过使用多种蛋白质工程技术，如蛋白质表面展示，人工进化等方法，设计和制备具有特定功能的蛋白，如抗体、酶、受体等。
E3泛素连接酶参与真核生物的多种生物学过程，许多E3泛素连接酶的活性可以用催化半胱氨酸反应的探针来检测，然而像cullin-RING泛素连接酶（cullin-RING ubiquitin ligases, CRLs）家族缺乏活性位点，而是连接底物和泛素携带酶。
CRLs是一个蛋白复合物，它发挥泛素化功能的过程是：cullin的N端和底物结合模块结合，随后C端与RBX1蛋白的RING结构域以及泛素携带酶结合，最终泛素携带酶将泛素转移到底物上，模块化的CRL架构，多样性的泛素携带酶，以及大量的底物结合模块组合，产生了一个由数百个具有不同功能的独特E3连接酶复合物家族。
有研究表明，NEDD8修饰到CUL1的WHB结构域时，会改变CUL1的构象，从而结合并激活泛素携带酶，最终使CUL1的泛素化效率增加了1000倍，WHB区域在CUL1,CUL2,CUL3和CUL4中是同源的，表明CRLs都可以与NEDD8形成共价连接。NEDD8与cullin蛋白的共价结合被称为拟素化(neddylation)，目前的模型表明，在底物降解后，大多数CRLs是去拟素化的，表明NEDD8与cullin的结合是CRLs激活的标志，为了寻找可以与激活态CRLs结合的探针，作者利用噬菌体展示产生抗原结合片段，首先是两轮阴性筛选，选择与未激活态的CRLs和NEDD8不结合的抗原结合片段，然后再从中筛选与激活态CRLs结合的抗原结合片段，最终筛选到了只特异性与NEDD8共价结合的cullins结合的探针，该探针将促进CRLs降解药物的开发。
原文链接：https://www.nature.com/articles/s41589-023-01392-5原文引用：DOI: 10.1038/s41589-023-01392-5
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