分享一篇发表在ACS Chem. Biol.上的文章：Discovery of a Tunable Heterocyclic Electrophile 4-Chloro-pyrazolopyridine That Defines a Unique Subset of Ligandable Cysteines，通讯作者是美国国家癌症研究所的Euna Yoo研究员，她的课题组的研究方向主要是将天然产物启发的化学蛋白质组学应用于免疫和肿瘤研究。在这篇文章中，作者报告了一种新型的半胱氨酸反应性亲电试剂4-氯吡唑并吡啶。
目前，共价抑制剂的设计主要通过将亲电官能团连接到已知非共价配体上来靶向特定蛋白质亲核残基。但大部分工作局限于卤代乙酰胺和丙烯酰胺等少数亲电基团，这限制了进一步对亲电基团的反应性调节，使得只能依赖于非共价配体进行选择性靶向。在这方面，基于芳香亲核取代的杂环warhead是一种可能的选择。作者在此前的工作中合成了一个共价片段库，以3-溴-4,5-二氢异恶唑（BDHI）作为靶向半胱氨酸的反应基团。在筛选过程中作者发现化合物BDHI-151具有独特的蛋白质组反应性，可以竞争性阻断碘乙酰胺（IA）探针的标记信号。通过合成BDHI-151的desCl和desBr类似物，作者证明了BDHI-151的半胱氨酸反应性主要来自于4-氯吡唑并吡啶（CPzP）的芳香亲核取代。随后，作者分别利用碘乙酰胺-脱硫生物素（IA-DTB）和炔基功能化的BDHI-151类似物的竞争性化学蛋白质组学策略分析了BDHI-151靶向的半胱氨酸位点。对鉴定的蛋白进行分析，作者发现参与蛋白、DNA、RNA或杂环化合物结合的蛋白具有较强的富集，这可能归因于吡唑并吡啶部分与嘌呤碱基的结构相似性。作者也通过蛋白质印迹证明了部分靶标与BDHI-151的结合。然后，作者合成了一系列CPzP类似物，同样通过竞争性化学蛋白质组学策略对这些类似物的半胱氨酸反应性进行了分析。在所有化学蛋白质组学分析中，作者发现PREP C255是CPzP靶向程度最高的位点之一。于是作者通过一系列实验证明了CPzP通过结合PREP的C255这一非催化半胱氨酸残基，从而抑制PREP的活性。总的来说，这篇文章中作者发现了一种新型的靶向半胱氨酸的杂环亲电试剂4-氯吡唑并吡啶。原文链接：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acschembio.4c00025文章引用：10.1021/acschembio.4c00025
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