推荐一篇发表在Anal. Chem.上的论文,题目为“In-Depth Endogenous Phosphopeptidomics of Serum with Zirconium(IV)-Grafted Mesoporous Silica Enrichment”,通讯作者是来自隆巴迪综合癌症中心的Junfeng Ma教授,马教授课题组主要致力于翻译后修饰方面的研究,这项工作主要是制备了一种锆(IV)修饰的多孔介质用于富集内源性的磷酸肽。
内源性肽是由3至100个氨基酸组成的多肽,在组织、细胞和体液中广泛分布。其生成主要经由前体蛋白的裂解或通过基因编码过程产生的生物活性肽。内源性肽可能会经历翻译后的修饰,如磷酸化。然而新的研究表明,人类血清中内源性磷酸肽能够提供宝贵的生理和病理状态信息,并且有望作为潜在的生物标志物,用于疾病的诊断和监测。与磷酸化的蛋白质组学相比,在生物体液中全面表征内源性磷酸肽存在技术上的挑战。为了对丰度更低的内源性磷酸肽进行高灵敏检测,强大且高度选择性的富集至关重要。其中,具有磷酸特异性亲和的多孔材料备受青睐,由于其可排除蛋白质(以及其他大分子),从而直接富集内源性磷酸肽。因此作者建立了一种新的策略,用于分析血清样品中的内源性磷酸肽。具体来说,在硅基介孔材料MCM-48(孔径约为2.5 nm)引入Zr4+。首先用酸处理MCM-48微球以产生足够的-OH基团用于修饰,然后用APTES和戊二醛顺序激活,然后引入功能试剂AMPA以产生功能性的磷酸基团,使得Zr4+能够通过螯合作用固定到MCM-48介质上。然后作者对合成的beads进行了一系列的表征,并且在富集内源性磷酸肽性能方面进行了评价,结果表明该beads具有良好的磷酸肽捕获选择性和较高的可重复性。作者将该方法用于直接捕获来自五例胰腺癌和五例健康志愿者的血清样品中的内源性磷酸肽。总共鉴定来自64个前体蛋白的329个内源性磷酸肽,提供了迄今为止血清样品中最大的内源性磷酸肽数据集。另外,作者也做了对应的磷酸蛋白质组的实验,将其与磷酸肽组的数据进行比较,两项研究之间仅有5个蛋白重叠。这些结果表明内源性磷酸肽组和磷酸蛋白质组几乎完全是不同的群体。由于二者都提供独特信息,同时分析两者将有助于获得磷酸化事件的全面图谱。总之,这篇论文发展了一种新型材料用于血清样品中内源性磷酸肽组的分析,为内源性磷酸肽的生物标志物发现提供有力工具。原文链接: https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.analchem.3c02150文章引用: https://doi.org/10.1021/acs.analchem.3c02150
目前评论: