分享一篇发表在Nature上的文章，文章的题目为“Bridge RNAs direct programmable recombination of target and donor DNA”，通讯作者为Arc研究所的联合创始人和核心研究员，加州大学伯克利分校生物工程的Patrick D. Hsu助理教授，研究方向是基因编辑领域。
基因组周围的可移动基因元件特别令人感兴趣，其中插入序列 （IS） 是一些最简单、紧凑的可移动基因元件，在细菌和古细菌中大量存在。许多表征的 IS 元件使用自编码的转座酶，通过蛋白质-DNA 相互作用识别末端反向重复序列 （TIR），由此对重编程其靶点造成了极大的挑战。而IS110元件通常缺乏TIR，并且似乎以序列特异性方式整合，靶向微生物基因组中的重复元件，其DNA 识别和重组机制尚不清楚，但先前的研究表明，重组酶开放阅读框侧翼元件的非编码末端调节重组酶的表达。在此，作者发现IS110元件经编码的重组酶重组后产生环状结构，启动表达结构化的非编码RNA，可以特异性地结合其编码的重组酶。此外，这个RNA包含两个内部环，通过碱基配对相互作用分别识别 IS110 DNA 供体及其基因组插入靶点，从而促进 DNA 重组。作者在体外重建了此重组体系，证明了此 RNA的桥连功能。通过构建重组报告基因系统，作者证明了桥RNA的靶结合环和供体结合环可以独立地重新编程，以指导两个不同DNA分子之间的序列特异性重组。总之，这篇文章报道了IS110重组系统，扩展了核酸引导系统的多样性，通过序列特异性插入、反转和切除实现了 DNA 的重编辑。原文链接：https://doi.org/10.1038/s41586-024-07552-4文章引用：DOI: 10.1038/s41586-024-07552-4
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