分享一篇发表在JACS上的文章，题目为Quantitative Proteomics Identifies Profilin-1 as a Pseudouridine-Binding Protein。本文通讯作者为加州大学河滨分校的汪寅生教授。汪寅生课题组从事多个领域的研究，包括DNA损伤修复、表观遗传学以及蛋白质组学。
假尿苷（Ψ）是自然界中丰度最高的RNA修饰类型，然而，人们对这种修饰核苷的生物学功能了解不多。为了更好地了解 RNA 中 Ψ 的生物学功能，研究人员采用了基于细胞培养中氨基酸稳定同位素标记（SILAC）的定量蛋白质组学方法，系统筛选了能与含Ψ的RNA结合的蛋白质。基于人源TERC mRNA，研究人员设计了5′-生物素标记的含Ψ RNA作为诱饵，并使用相应的含尿苷RNA作为对照。通过正向和反向SILAC实验，研究人员揭示多种蛋白质能够优先与含Ψ的RNA结合。其中，细胞骨架蛋白PFN1仅被含Ψ的RNA探针富集，表明其在RNA中优先与Ψ结合，而不是与 U 结合。研究人员证明了PFN1可直接选择性地结合到含Ψ的RNA。基于iCLIP技术，研究人员在人体细胞中发现了约4000个PFN1结合位点，其中包括编码三糖磷酸异构酶的TPI1 mRNA中一个已知的 dyskerin (DKC1) 安装的Ψ位点。此外，研究人员还发现PFN1和DKC1通过调节PFN1-Ψ相互作用，对调节TPI1 mRNA 的稳定性和翻译效率至关重要。研究人员确定了PFN1是RNA中Ψ的阅读蛋白，并说明了PFN1-Ψ相互作用在转录后调控中的潜在作用。这些发现为Ψ在RNA生物学和调节重要代谢酶表达中的功能提供了新的见解。综上所述，本文基于含Ψ的RNA诱饵，揭示了一系列潜在的Ψ结合蛋白，并对PFN1的功能进行深入研究。原文链接：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.4c17659原文引用：10.1021/jacs.4c17659
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