与大家分享一篇Nature communication上的文章"A general approach to visualize protein binding and DNA conformation without protein labelling"。

    protein–DNA interactions不仅影响到染色体的凝聚与分离，而且关系到染色体的复制和修复，因此具有十分重要的生物学意义。但是现有的通过在蛋白上进行荧光标记来观测protein–DNA interactions的方法存在着蛋白标记会影响蛋白活性以及荧光标记背景较高的缺点。因此，本文作者开发了一种非蛋白标记的可视化protein–DNA interactions的方法。简单来说就是在DNA上稀疏结合Cy3染料，并将其一端固定于玻片上，同时利用流动液保证DNA的舒展状态，而当蛋白与DNA结合后就会因为protein-induced fluorescence enhancement (PIFE)而使原来的荧光信号增强。因此可以通过检测荧光信号的变化来表示蛋白与DNA的结合，同时通过DNA的荧光长度来表征DNA的变构情况。作者首先在DNA结合蛋白Spo0J上进行了研究，并且对于Spo0J R82A（只具有结合活性却不能使DNA变构）进行了研究加以确认。文章称本方法理论上可以用于所有DNA结合蛋白的研究。

    本方法即解决了现有方法的不足又可以同时研究蛋白的结合以及DNA的变构，一举两得，可供大家参考。

Song, D. et al. A general approach to visualize protein binding and DNA conformation without protein labelling. Nat. Commun. 7:10976 doi: 10.1038/ncomms10976 (2016).