Angew. Chem. Int. Ed. | Endo-M介导的化学酶法用于糖肽的可逆标记

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分享一篇发表在Angew上的文章:Endo-M Mediated Chemoenzymatic Approach Enables Reversible Glycopeptide Labeling for O-GlcNAcylation Analysis,三位通讯作者分别是:大连化学物理研究所的秦洪强研究员,课题组研究方向是蛋白质翻译后修饰和糖基化;中国科学院大学的黄蔚研究员,课题组研究方向是抗体药物、天然产物、药物受体、细胞表面糖基化;大连化学物理研究所的叶明亮研究员,课题组研究方向是蛋白质质谱、复杂生物样品预处理等。

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O-GlcNAc是一种重要的蛋白质翻译后修饰,参与转录、信号转导等多种生物功能。目前在基于LC-MS/MS的糖肽分析中,常用的糖肽富集方法是化学标记法,即通过化学酶法或者非天然糖代谢标记引入生物正交基团。然而,化学酶法不可避免地在糖肽上引入大质量标签(>300 Da),这些标签抑制了肽在质谱中的电离,使质谱谱图复杂化,影响了鉴定效率。众所周知,N-糖修饰肽段可以通过亲水相互作用液相色谱(HILIC)实现选择性富集。然而,对于O-糖修饰肽段而言,因为聚糖结构较小,亲水性较低,所以HILIC并不适用。本文研究中,作者希望利用化学酶法延长肽段中的O-GlcNAc聚糖,并像N-糖基化肽段那样利用亲水相互作用液相色谱进行分离和富集。

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据文献报道,Endo-M是一种endo-β-N-乙酰葡糖胺糖苷酶,这种酶的独特之处在于它可以将N-聚糖的寡糖整体转移到不同的受体上,从而产生多种糖缀合物。此外,Endo-M的突变体Endo-M N175Q却具有更强的糖合成酶活性,水解活性显著降低。作者首先使用了人工合成的O-糖基化修饰肽段(SGP1, NNLEES(GlcNAc)LLKLE)来评价Endo-M N175Q的酶活性。MALDI-TOF MS的结果表明,SGP1在经过Endo-M N175Q和N-glycan恶唑啉(CT-ox)共处理后, SGP1能被CT-ox标记,转化效率高达95.8%。随后,作者利用HILIC实现了对标记后SGP1的分离。在实现O-糖基化肽段富集后,作者又利用野生型Endo-M将添加的聚糖分子可逆去除,生成的无标记O-糖基化肽段用于后续的LC-MS/MS分析。与经典的化学酶标记相比,该方法实现了无标签的富集,消除了大标签对糖肽检测的干扰。

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在成功建立了O-糖基化肽段可逆标记和富集的方法后,作者将其应用到细胞核糖蛋白质组研究上,并从133 μg样品中鉴定到73个糖蛋白,包括120条非冗余糖肽,而没有经过Endo-M处理的样品只能鉴定到10%的糖肽,说明该方法能显著提高O-GlcNAcylation的鉴定覆盖度。
综上所述,本文发展了一种从复杂样品中富集O-GlcNAc肽段的方法,提高了O-糖肽的鉴定效率。

本文作者:MB

责任编辑:JGG

原文链接:https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.202117849

文章引用:DOI:10.1002/anie.202117849


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