来自UCSF James A Wells 组的一篇JACS，利用改造的NEDD8 ligase 酶对活性小分子靶标蛋白质进行邻近化学标记，为小分子的靶点鉴定提供给了一种新策略。在2013年的Molecular Cell 中，作者为了鉴定E3 ligase的底物蛋白，在内源性泛素降解系统的启发之上，构建了一个生物正交的标记体系，称作 NEDDylator。和泛素类似，NEDD8是一个内源性的蛋白质，可以和底物蛋白质表面的lysine发生共价反应，但不能被降解，因此可以对E3 ligase的底物进行共价标记并鉴定。本文中作者换了一种思路，利用该体系鉴定活性小分子的靶标蛋白质。该正交体系将SNAP tag和NEDD8 E2 连接在一起，SNAP tag 作为一个通用平台，共价连接着小分子，当小分子和靶标蛋白质相结合时，拉近了NEDD8之间的距离，因此标记又biotin的BEDD8可以共价的标记在靶标蛋白质的表面，后续富集鉴定可以准确的知道小分子的靶标蛋白质。类似于  BioID 和 APEX，该体系利用邻近化学的策略，用一种新的思路成功的解决了小分子靶标鉴定的问题，是一项很有意思的工作。

文章引用：Direct proximity tagging of small molecule protein targets using an engineered NEDD8 ligase.J. Am. Chem. Soc., DOI: 10.1021/jacs.6b06828

文章链接：http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/jacs.6b06828