分享一篇发表在nature杂志上的文章,题目为“The polar oxy-metabolome reveals the 4-hydroxymandelate CoQ10 synthesis pathway”。文章的通讯作者是来自纽约大学的Michael E. Pacold教授,他们课题组主要从事疾病代谢组学相关的研究。众所周知,氧气在人类生命活动所必须的新陈代谢过程中起着至关重要的作用,但是哺乳细胞中氧气依赖的代谢反应过程类型仍有待探索。本文中利用代谢标记细胞的策略来追踪氧气参与的代谢物合成途径,作者发现了一个带有氧18标记特征的未知代谢物,它的氧18标记形式随着氧浓度的增加而递增。将未知代谢物的二级碎片组成以及色谱保留时间与标准品进行比对,确认了该代谢物为4-羟基扁桃酸乙酯(4-HMA)。
作者紧接着对4-HMA的来源进行了探究,通过分析碳13标记的重标酪氨酸和苯丙氨酸掺入新合成4-HMA的效率,作者发现4-HMA的骨架主要来源于酪氨酸。在细菌中,4-HMA的合成是在羟基扁桃酸合酶(HmaS)的催化下进行的,但是其在人源细胞中的合成途径目前未知。通过一系列的生化实验作者发现4-HMA的合成过程依赖于一个具有HmaS类似活性的铁双加氧酶,在人类细胞中这样的酶有两个:HPD 和HPDL。基因和蛋白质水平的序列比对结果显示HPDL比HPD更接近HmaS,实验结果也证实HPD的敲除不会影响4-HMA的水平,但是HPDL的敲除则会明显抑制从酪氨酸产生4-HMA的效率。因此作者得出,4-HMA是在HPDL双加氧酶的催化作用下从酪氨酸合成而来的。
在原儿茶酸合成途径中,4-HMA会降解为对羟基苯甲酸(4-HB),在人类细胞中,4-HB是辅酶Q10(CoQ10)具有氧化还原活性头部基团的前体,因此作者提出:人类细胞是否会利用4-HMA产生4-HB进而生成CoQ10?利用碳13标记的Tyr追踪发现有来源于酪氨酸的CoQ10合成,而且该合成途径可以通过抑制HPDL活性而被阻断,因此作者得出:HPDL和4-HMA都参与到了CoQ10的生物合成。CoQ10对于肿瘤生长有重要作用,将表达有正常以及点突变失活HPDL的PDAC细胞注射裸鼠,发现HPDL失活组的肿瘤重量明显低于正常组,因此作者得出:HPDL的活性会促进PDAC肿瘤的生长和存活,但是具有细胞种类间的异质性。
综上,作者利用氧18代谢标记的策略筛选到了氧气代谢的产物4-HMA,并首次证明4-HMA是由HPDL蛋白催化产生的,丰富了我们对HPDL蛋白功能的认识。作者证实了4-HMA作为中间体参与到人类细胞的CoQ10合成途径,近期的研究发现HPDL表达水平失调会导致神经性疾病及癌症的发生发展,HPDL与CoQ10之间的联系为这方面的功能机制研究提供了重要线索。
本文作者:XWD
责任编辑:LDY
文章链接:https://www.nature.com/articles/s41586-021-03865-w
原文引用:DOI:10.1038/s41586-021-03865-w
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