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分享一篇来自ACS chemical biology的文章,题名为“A Fluorescence Polarization Assay for Macrodomains Facilitates the Identification of Potent Inhibitors of the SARS-CoV‑2 Macrodomain”。
干扰素(IFN)通过将宿主细胞蛋白质ADP-核糖基化以抵御病毒入侵,然而包括SARS-CoV-2等许多病毒可以利用非结构蛋白的大结构域,通过水解ADP-核糖基化蛋白质以消除IFN的抵抗作用,因此大结构域是潜在的抗病毒药物靶点。在本文中,作者利用SARS-CoV-2大结构域的这一特性,将其底物ADPr通过linker连接在TAMRA荧光基团上用于SARS-CoV-2大结构域抑制剂的高通量筛选。
首先作者合成了ADPr-N3,通过click反应合成α-TAMRA-ADPr,利用其与大结构域潜在抑制剂之间的竞争,当所筛选的为潜在抑制剂时,α-TAMRA-ADPr无法结合大结构域因此具有高自由度,其具有低荧光偏振(fluorescence polarization,FP),反之则具有高荧光偏振,通过检测其FP以高通量筛选潜在的大结构域抑制剂。
接着作者验证了α-TAMRA-ADPr与SARS-CoV-2 Macro 1的结合效率,对测试了其对SARS-CoV-2大结构域的选择性。
然后作者使用已报到的SARS-CoV-2抑制剂Z8539和GS-441524验证猜想。
最后,观察到对ADPr C1位置的修饰并没影响其与SARS-CoV-2大结构域结合这一现象,作者设计了TFMU-ADPr和pNP-ADPr两种探针并进行了表征。 本文作者:WWZ 责任编辑:FC DOI:10.1021/acschembio.3c00092 https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acschembio.3c00092
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